最早期的基因工程药，本来就是来自于人体内真实存在的抵制疾病的生物分子，比如干扰素、白介素、EPO之流的，包括胰岛素，（侯云德院士因为发现第一个中国人的干扰素运德素及其基因工程产业化，前年获得了国家最高科技奖），显然这些药不可能依赖于从人体内提取来实现产业化，就用基因工程的办法在其他物种里高效表达生产，这是世界上第一代基因工程药；

后来的基因工程抗体药，有一些是用老鼠等对人体内真实的疾病靶标抗原产生的抗体进行人源化（降低免疫原性），采用基因工程的办法同上在其他物种体内表达生产，这是目前为止最辉煌的一代生物药。之前出来一个基本上就是贵族药；

现在还有直接用人体内产生的抗体来作为模板，采用基因工程技术用其他物种生产的，生物技术在上游的一些技术现在更新比较快。

上面三种都没有把新的基因带到使用者的人体内（病毒药另讲）。

转基因实际上是另外一种概念，比如把昆虫的分子甚至细菌的基因转到跨度很大的植物高等动物里面去并形成稳定遗传，跟传统的近亲物种杂交在基因来源和灵活度上非常不同但在稳定遗传上又比传统杂交一些无后品种（比如骡子）要好或与有后品种同等。